La ponencia da cuenta de resultados de investigación que abordan los desafíos epistemológicos que emergen ante la articulación de los conocimientos escolares con los conocimientos educativos indígenas, desde la perspectiva de profesores de ciencias naturales. Se problematiza que la educación en ciencias naturales se caracteriza por un racismo epistémico arraigado tanto en el currículum escolar como en la formación inicial docente monocultural eurocéntrica, lo que limita la incorporación de los saberes y conocimientos educativos indígenas en el aula.La metodología es cualitativa, se utilizaron entrevistas semi estructuradas a  profesores de ciencias naturales con quienes se profundizó en sus percepciones sobre la articulación del conocimiento escolar de las ciencias naturales con el conocimiento educativo mapuche. Los principales resultados dan cuenta de un posicionamiento epistemológico de corte eurocéntrico occidental. Asimismo, se constata el desconocimiento sobre saberes y conocimientos indígenas que se relacionan con las ciencias naturales. Concluimos en la urgencia de repensar la formación inicial docente en ciencias naturales con el propósito de posibilitar una articulación entre el conocimiento escolar en ciencias naturales y el conocimiento educativo mapuche.