En esta ponencia se pretende analizar los retos que enfrenta el denominado diálogo de saberes como una filosofía emergente en el marco de la puesta en marcha de medidas que pretenden interculturalizar la Educación Superior impartida por los Estados en donde la diversidad cultural es una condición inherente. Para ello se analiza el caso del Programa Universitario de Estudios de la Diversidad Cultural y la Interculturalidad de la Universidad Nacional Autónoma de México (PUIC-UNAM), que busca interculturalidad la Universidad y se compara con el modelo de trabajo de la Universidad Intercultural de Espinal, Veracruz. En ambos casos se parte de datos empíricos. En la UNAM se registran todos los días información de alumnos indígenas y no indígenas que participan en la materia optativa transversal y en el Sistema de Becas. Por lo mismo, se ha logrado acumular una experiecia de cerca de 15 años de trabajo. En la Universidad Intercultural de Espinal, se realizó trabajo de campo, entrevistas a profundidad, observación participante. Además de análisis de fuentes documentales y bibliográficas, sistematizadas en el software Atlas T. La ponencia analiza estas propuestas en el marco del desarrollo que en las últimas dos décadas se ha dado al Sistema Universitario Nacional, para generar propuestas cuyo objetivo ha sido el tránsito hacia una reformulación profunda de los paradigmas socio-pedagógicos vigentes, con el objetivo de construir nuevos programas, planes y sistemas de educación pública más incluyentes y democráticos que brinden una respuesta más clara a las demandas y reivindicaciones de los pueblos originarios. Se pretende enfatizar en las notorias insuficiencias para enfrentar el reto de construcción de modelos adecuados orientados a integrar la pertinencia cultural de los pueblos indígenas en los cursos y programas educativos.